南瓜子生吃、熟吃都可以，都不会对身体造成危害。
每天吃50克左右的南瓜子，可有效防治前列腺疾病。这是由于前列腺的分泌激素功能要依靠脂肪酸，而南瓜子就富含脂肪酸，可使前列腺保持良好功能。所含的活性成分可消除前列腺炎初期的肿胀，同时还有预防前列腺癌的作用。南瓜子含有丰富的泛酸，这种物质可以缓解静止性心绞痛，并有降压的作用。南瓜子对血吸虫也具有很好的杀灭作用，是血吸虫病的首选食疗之品。
建议适量食用，南瓜子补的作用比较强，每天吃上50克左右的南瓜子就可以了，吃太多补过头也不好。
南瓜子可以生吃，但是多吃不易消化，会排较多肠气。生南瓜子有一定毒性，少量吃可以打虫，吃多会中毒。南瓜子晒干，熬水喝可以有杀虫的功效驱猪肉绦虫，蛔虫都是很有效的。
生吃好。有杀虫的治疗前列腺疾病的食疗作用。南瓜子有很好的杀灭人体内寄生虫的作用。对血吸虫也具有很好的杀灭作用，是血吸虫病的首选食疗之品。每天吃上50克左右的南瓜子，可较为有效地防治前列腺疾病。
高血脂患者建议暂不要吃南瓜子这种食品。
由于南瓜子属坚果类，坚果类食品表面虽看不出油脂类，但这类食品含脂肪较多，而属于隐形脂肪。另外，如果这种食物摄入过多时，就会造成血脂升高。因此得了高血脂这种病，当需要低油、低脂饮食时，就是要停食此类食品，在病人的高脂血症痊愈后，可少量服用，当然，进食量要控制，不然很可能又会引起高脂血症这种病的发生。
对于肾结石患者来说，平时是可以通过吃一些南瓜子的。
南瓜子能促进结石的排泄，对肾结石有一定的辅助治疗效果。南瓜子可以防止前列腺癌，这是因为南瓜中的有效成分，可以有效的缓解前列腺炎的症状。如果出现了肾结石，需要立即到医院就诊。肾结石的治疗与结石的大小有关，如果结石很小，可以不去管，多喝水，促进结石的排泄，如果结石很大，可以选择药物或者手术。肾结石的人可以多吃黑木耳，尽量少食用盐，也可以避免食用菠菜，这是对结石的影响。
炒熟之后，直接吃就可以驱虫的，具有益气消炎，止痛解毒，杀虫，降血糖，解除干渴的功效，可用来治疗脾胃虚弱，糖尿病，蛔虫等疾病。南瓜子中富含丰富的维生素和果胶，具有很好的吸附作用，可以有效的清除体内的细菌、毒素及其他有害物质，能起到一定的解毒作用。