肛肠镜检一般不会引起疼痛，但会有下腹部及肛门处胀胀的感觉病人可以耐受。镜检时会在肛门镜外壁涂抹石蜡油起到润滑的作用，方便镜子进入肛门。但如果肛门有病变，如肛裂、肛周脓肿、外痔及内痔炎症感染时，肛门镜检会因肛门镜摩擦病灶而出现疼痛不适。尤其是肛裂病人疼痛剧烈，原则上该类不予肛门镜检。
肛肠镜检查没有严重的痛苦，部分人会感觉轻微不适。痛苦的程度决定因素如下：肛周本身的疾病种类。如果是肛裂或者肛周脓肿，则痛苦较重一些，如果是单纯的痔疮，没有嵌顿则痛苦轻一些。病人本身的敏感程度，敏感程度越高，痛苦越明显。操作的轻柔程度。操作的手法越轻柔，痛苦就会越小。设备的先进程度。操作的设备越先进越符合人体的生理情况，则痛苦越轻。
无痛肠镜检查一般是不痛苦的。具体情况分析如下：
无痛肠镜主要是用丙泊酚做全身麻醉的，病人在麻醉后是没有意识的，但是在做结肠镜的时候，需要注入适当的气体，观察肠腔的情况，为了观察病变，可能会反复的进镜观察，有时会导致肠腔内有大量气体，醒来后会出现肚子绞痛，顺时针揉肚子排出气体就可以了。总体来说，无痛肠镜是一个不错的选择。
肛肠镜检一般不会引起疼痛，但会有下腹部及肛门处胀胀的感觉病人可以耐受。镜检时会在肛门镜外壁涂抹石蜡油起到润滑的作用，方便镜子进入肛门。但如果肛门有病变，如肛裂、肛周脓肿、外痔及内痔炎症感染时，肛门镜检会因肛门镜摩擦病灶而出现疼痛不适。尤其是肛裂病人疼痛剧烈，原则上该类不予肛门镜检。
检查无痛胃肠镜会进行人体麻醉，是不痛的，具体分析如下：
通过对病人进行麻醉剂的注射后，病人就会失去知觉，被检查时就不会感觉到疼痛。但是有呼吸暂停综合征、打鼾、喘鸣等症状的病人不宜进行无痛麻醉，也包括高龄、心脏功能不全、妊娠、等人群。目前在临床上，异泊酚是通过静脉注射的，异泊酚会在0.5-1min内失去知觉，停止使用药物后会很快苏醒并恢复知觉和方向感。
无痛肠镜的检查一般是1000元左右。
无痛胃镜检查的费用大约在1000元左右。不同级别的医院价格也会有所不同。无痛胃镜需要进行全麻一般胃镜的费用在300元左右，而全麻的费用包括了静脉注射药物的费用以及麻醉的费用，价格一般在500到700元左右，总费用一般是1000元左右。如果有心脏病或者是慢性的疾病，还是不适合做无痛胃镜检查的。不然在全麻的时候，有基础病的人很容易发病。另外，在胃镜前要进行术前的九项检查，费用一般是100元左右，如果要做活检以及病理检查，还要增加300元左右。
