腱鞘囊肿绝大部分不癌变。
如果出现症状时没有得到及时正确地处理的话，就会对人造成一定的影响和伤害。这个几率是很低的。一旦发现有了腱鞘囊肿，就应该立即到专业机构做进一步检查。有这类病的人，不要心理压力过大。同时还要注意定期复查关节情况以及周围组织器官变化等。应及早到二级及以上医院骨科就诊，与医生合作积极救治，力争尽早让囊肿位置退去。此外，当病情达到减轻后，必须听医生的话，预防腱鞘囊肿的复发。
囊肿不会癌变，但有些癌在病变过程中会长成囊肿。囊肿的囊壁是一层膜状结构，其内皮有分泌功能，能分泌浆液，如腱鞘囊肿、肾囊肿等，这些囊肿是良性病变，不会癌变。而在一些癌性病变，当肿块中间发生缺血坏死，坏死组织液化并被包裹，形成囊性结构，或一些恶性病变中具有一定的分泌功能的癌细胞逐步增长，形成囊性结节，就是癌性囊肿，如粘液囊腺癌。
宫颈囊肿一般为良性、炎性反应，不会癌变。如无白带异常或反复的阴道炎症，可不用治疗。如囊肿较大或伴有宫颈糜烂，出现腰酸、腹部坠胀、白带增多有异味或反复发作的阴道炎症，如果囊肿太大或者多发性的就要考虑去医院治疗。
宫颈囊肿切除后易复发，但不一定会癌变，每年做一次宫颈的检查，只要没有宫颈癌前病变，问题不大，宫颈囊肿可以不治疗。囊肿属于良性病变，会越来越大，应及时就诊，积极配合医生进行合理的治疗措施。
理论上巧克力囊肿是不会癌变的。但是长期的巧克力囊肿，比如有10年、15年、20年的人，会发现巨大的巧克力囊肿一直保留在体内，没有做手术的时候往往会有癌变的可能，但癌变率极低，不超过5%。
前列腺囊肿生发生癌变的机会非常少，囊肿是一种良性肿瘤，但是也有可能癌变，但是几率比较小，出现囊肿可马上采取手术切除，问题应该不大，如果放任不管，囊肿也会变大而引起一些不良反应。
