不同病因的腮腺炎在临床的治疗方法不同，腮腺炎大多由金黄色葡萄球菌或链球菌感染引起，腮腺局部红肿热痛，挤压腮腺导管口有脓液溢出。其治疗上主要以抗病菌类的药物治疗。
出现腮腺炎等引起来的不适，一定要尽早及时的治疗，可以通过抽血化验确诊，特别是流行性腮腺炎，会有一定的传染性，要隔离治疗，早期的治疗可以有效的防止并发症的发生。近期还是注意多休息，避免到人多的地方，以免造成相互交叉感染的现象。一般需要7~10天左右会基本愈合。
腮腺炎的治疗可以分为几期一、腮腺炎早期，可以使用药物治疗，同时可以刺激分泌，保持唾液分泌畅通。二、如果超过一周，进入化脓期以后，应该进行手术排出脓液。三、如果属于病毒性腮腺炎，没有特殊的治疗方法，可以使用抗病毒治疗。
治疗上主要是抗病毒对症支持治疗，但该病具有传染性，所以必须隔离，防止引起其他人群的感染，治疗期间注意休息，避免劳累，清淡饮食。腮腺炎是由于腮腺病毒急性感染，而导致的急性传染性疾病，主要表现为发热，以及耳根为中心局部的腮腺肿大。
成人腮腺炎应用抗菌药物静脉滴注，高热等全身症状显著可以短期内使用糖皮质激素。流行性腮腺炎需要积极抗病毒治疗，口服或者肌注抗病毒药物，同时需要传染病隔离两周。