毛囊炎的治疗要因病施治，因为毛囊炎的原因，包括细菌、真菌以及刺激，还有原因不明等。对于细菌性的毛囊炎，主要以抗生素软膏为主，对于真菌性的毛囊炎，以抗真菌药物为主，而对于刺激性的，以消除刺激因素为主，如果由搓澡、剃须不当等引起的，应去除刺激因素。
毛囊炎性脓疱疮应该先对毛囊进行杀菌，保持毛囊口的干净清洁，不要常常用手触碰毛囊地方，还可以选择性的用一些药物。饮食方面要忌吃酸辣等刺激性食物和油腻类食物，以清淡和水果蔬菜为主。
面部有毛囊炎可以使用一些质量好、无刺激的洗面奶洗脸护理，保持面部清洁，汗渍、灰尘、油脂都要及时清洗，避免堵塞毛囊，面部毛囊炎的护理与平时的饮食习惯以及卫生习惯是分不开的，饮食上一定要避免食用一些油腻辛辣刺激的食物，如烧烤、麻辣烫之类的食物，要以清淡的为主，多吃一些瓜果蔬菜是非常有必要的。
毛囊炎在治疗上首先要注意保持清洁，饮食要清淡，不要吃辛辣刺激和太油腻的食物，局部可以外用抗生素软膏。毛囊炎主要是金黄色葡萄球菌感染引起的毛囊疾病，表现为毛囊根部出现疼痛的丘疹脓疱。
首先可以口服减少面部油脂的分泌的中药或者西药。第二个就是让堵塞的毛囊口疏通开。可以通过面膜、果酸、水杨酸等疏通毛囊口的角栓。第三个是针对毛囊的炎症，可以口服一些具有消炎解毒散结作用的药物。
毛囊炎多由金黄色葡萄球菌感染引起局部的红肿疼痛，可能会有化脓感染。喝酒、进食辛辣食物刺激多为诱因。注意皮肤清洁，饮食避免辛辣刺激油腻的食物，戒烟酒，不可用手搔抓患处，以防继发感染。