支原体感染没有特效药，患者可以按医嘱使用抗生素进行治疗。
支原体感染的患者可能会出现局部炎症反应，目前并没有特效药可以直接治愈病症，患者可以按医嘱使用阿奇霉素、罗红霉素、红霉素等抗生素进行治疗，效果较好，可以有效促进病症恢复。
建议患者在医生的指导下使用药物，以免出现不良症状。
女性支原体感染以后，症状因感染部位而异。
若为泌尿生殖器感染，则可有尿频，尿急等症状、也有尿痛，若为宫颈感染，可有白带增多，浑浊等，宫颈水肿状况；若为呼吸道感染，可有咳嗽。
该病具有自限性，大部分病例未经治疗即可自愈。如果症状严重，可以采取喹诺酮类抗生素治疗。
支原体感染通常会引起呼吸道感染症状、泌尿生殖道感染症状、皮肤黏膜感染症状等。
支原体分肺炎支原体、解脲支原体、人型支原体，不同支原体感染的部位不同，症状也不同。患者应根据自身情况来判断自己是哪种类型的支原体感染，可在医生的指导下使用抗生素进行治疗。
支原体感染不一定是肺炎。
支原体肺炎属于引发肺炎的原因，但感染支原体不一定就是肺炎。支原体感染肺是由于支原体肺炎感染而引起的，而感染肺部的病毒、细菌和其他非典型的致病性的细菌也可能引起肺炎。支原体肺炎主要有发热、头疼、口渴、胃口下降等症状，在治疗上，可以选用抗支原体的药物，比如大环内酯类抗生素。
HPV不是支原体感染。
HPV指人乳头瘤病毒，能引起人体皮肤黏膜的鳞状上皮增殖，不是支原体感染。人乳头瘤病毒是一种病毒感染，支原体是一种介于病毒和细菌之间的微生物感染。支原体感染可以使用抗生素治疗，而对于高危人乳头瘤病毒感染目前还没有很好的药物。
儿童支原体感染是具有一定传染性的。
儿童感染上支原体后，通常会出现流鼻涕、打喷嚏、咳嗽等症状。由于支原体主要经口、鼻分泌物与痰的飞沫而传播，感染上支原体的儿童和其他人密切接触后，通常会传染给其他人。家长可以按照医嘱给儿童使用注射用头孢曲松钠、注射用头孢噻肟钠药物进行治疗。