灰指甲的治疗包括内服和外用两个方面，内服药治疗灰指甲是非常有效的。通过口服吸收，通过血液再循环到指甲并且进入甲板，这样才能够让指甲里边的抗真菌药达到一定的浓度，只有这样效果才会比较好。
甲癣是由皮癣菌侵犯甲板或甲下所引起的甲部疾病，而甲真菌病是由皮癣菌、非皮癣菌及酵母菌等真菌引起的甲感染。两者因治疗方法相同，灰指甲就是甲癣，因为指甲的变化有很多疾病可以引起，也可以发生一些颜色或者厚薄上的变化，甲癣就是真菌感染引起的灰指甲。
甲癣的治疗包括内服和外用两个方面，外用药的使用包括浸泡、封包等。对于不严重的甲癣治疗效果都是不错的，在使用之前最好先把病甲进行处理，把毁损甲面刮一刮，一方面保证药物能有更好的渗透性，能够起到更好的作用。
甲癣初期可以使用手术拔甲或单纯使用药物进行治疗等，灰指甲是由于真菌感染而导致的，是一种较为顽固的皮肤疾病，因此，其治疗也会有一定的难度。灰指甲初发时，其病症较为轻微，确诊为此病的病人，应把握时机，及时治疗。
治疗甲癣可以选用各种抗真菌的外用药膏进行治疗较好，另外也可以采用激光治疗，激光具有高靶向性、高能量的特点，能使病甲局部接受较高密度的能量并能够对病原菌有一定的抑制作用。