口腔溃疡与手足口病是两种不同的疾病，溃疡一般出现在平常不爱吃蔬菜水果的人群当中，要经常保持口腔、皮肤卫生，坚持经常刷牙、漱口、洗澡，少吃烧烤、油炸食物避免黏膜损伤，多吃蔬菜，补充足量的维生素，一般一周过后疼痛缓解伤口愈合，而手足口病是儿童传染性疾病，是由于肠道病毒引起的。多发生于5岁以下的儿童，平常应该不要到人群聚集，空气流通较差的公共场所，屋子经常要通风勤洗手，注意保持家庭卫生。
一般来讲，小儿手足口病导致口腔溃疡7-10天即可痊愈，小儿出现手足口病是因为小儿感染肠道病毒，如小儿感柯萨奇病毒或EV71病毒等。
小儿感染肠道病毒后可表现为手足及口部等部位的疱疹甚至臀部疱疹。口腔部位疱疹红肿后常引起口腔溃疡，适时服用抗病毒中成药后，如蒲地蓝消炎口服液或莲花清瘟胶囊，手足口病所致溃疡多可在7～10天内得到改善。
手足口病口腔溃疡应该及时到医院就诊，对症治疗，不要耽误治疗。在患病期间，应加强患儿的护理，作好口腔卫生。进食前后可用生理盐水，温开水漱口，食物以流质及半流质等无刺激性食物为宜。饭前便后、外出后要用肥皂洗手。
口腔溃疡不是手足口病，口腔溃疡和手足口病在发病机制，临床表现，治疗和预后方面有很大差异。首先，口腔溃疡病因不清楚，是在口腔粘膜上产生一种溃疡病，与细菌感染和病毒感染有关。然而，手足口病主要发生在5岁以下的儿童，并且口腔，手和脚的表面发生病毒感染，通常由胃肠病毒和柯萨奇病毒引起。
口腔溃疡不是手足口病，口腔溃疡多以溃疡的症状出现，而手足口疾病会有疱疹以及发热口痛的现象。孩子口舌生疮，多数是由于免疫力低下，缺乏b族维生素导致的口腔溃疡，应该结合临床症状选择药物的方式进行改善，平时要多休息，饮食要清淡。
口腔溃疡通常限于疼痛、发红、肿胀等。在口腔里。手足口病通常伴有发烧，或红疹皮肤和四肢水泡。因此，应尽快注意调节和观察。然而，对症状的判断仍然存在局限性和错误。应该尽快对儿童进行血液检查，以帮助诊断疾病。确诊后，应根据疗程服药。