一般来说，对于甲状腺功能亢进的药物，其不良反应主要有三种：
第一种情况，就是服用了药后会有皮疹，这属于一种过敏性的症状，一般会在全身和身体的不同地方都会有皮疹。
第二种是肝功异常，转氨酶增高是甲亢病人的主要症状，肝功异常、转氨酶增高等都很常见。
第三是由于服用了甲亢药物，导致白细胞减少，白细胞的总量减少后，嗜酸性粒细胞的绝对数值也会减少。
对于甲亢的治疗，适合自己的，才是好的治疗方法。抗甲状腺治疗分别为口服药物治疗、手术治疗以及放射碘治疗。口服药物治疗，是因为它的服药方式比较简单，费用比较低。依从性比较高，目前使用最普遍。
目前临床上治疗甲亢的药物包括甲巯咪唑类和丙硫氧嘧啶类药物两种。一般丙硫类通过胎盘比甲巯咪唑少，对胎儿的不良反应相对较小，是孕妇甲亢的首选用药。大多数非妊娠期应首选甲唑类药物进行治疗。在服用抗甲状腺类药物的过程中，应定期监测白细胞和肝功能。若白细胞和肝功能无异常，可以继续服用药物，治疗时间大约为1.5-2年。若白细胞和肝功能出现异常，应积极调整药物剂量或者改用放射性碘或手术治疗。
治疗甲亢的中药有很多，具体分析如下：
现阶段临床研究说明，中药对甲亢病有良好的改善和疗效，在甲亢治疗全过程中，中医学常常开展辩证剖析和医治。治疗甲亢的常见中药有四海舒郁丸、甲亢灵颗粒等，均为临床医学常见的治疗甲亢的中药类药。在用药物调理治疗甲亢疾病时，建议患者严格控制饮食，不吃含碘食物。严禁饮酒，病人要适当锻练，合理饮食，注意休息。
甲亢指的是甲状腺功能亢进症。通常情况下，甲状腺功能亢进症指甲状腺腺体本身产生甲状腺激素过多而引起的甲状腺毒症，患者可能会出现紧张失眠、焦虑烦躁、易激动等症状，如果患者出现了情绪激动、心烦症状，可以用海藻玉壶汤、消瘿颗粒等经方进行治疗能起到辅助治疗的效果。
如果患者出现了夜间潮热、躁动不安、痛经、经血色暗等症状，可以用逍遥丸、桃红四五汤等经方进行治疗能起到辅助治疗的效果。
治疗甲亢首先可以服用抗甲状腺药物治疗，据甲功结果调整药物剂量。也可以做放射性碘131治疗，术后需要甲状腺激素补充治疗。对于甲状腺明显肿大，出现压迫症状，中重度甲亢长期服药无效，停药复发或不能坚持服药者，手术治疗是首选。