如果患者药物流产之后发现宫内有残留，可以有两种处理方法：
患者可以进行保守治疗，但前提条件是没有活动性出血，且残留的组织物小于一厘米。患者可以服药产复康颗粒或者五加生化胶囊等活血化瘀的药物，以促进残留组织物排出，如果阴道流血量增多应及时到医院再给予清宫手术。
如果残留的组织物比较多，或者是虽然组织物不多，但出血比较多，患者要及时进行清宫手术。
药物流产需要10-14天左右流干净。
女性在怀孕后可以通过药物流产或是人工流产将孕囊排出，如果选择药物流产的话，一般在服药后的第三天就能排出，排出时间在2-3个小时，且在10-14天才能完全流干净。如果在14天后仍然出现出血的情况，需要及时前往医院进行检查，如果宫腔内仍有残留物，需要进行清宫手术将残留物排出，避免出现感染。
药物人流没有彻底排出，可能表现为下腹部的不适、不规则的阴道出血，有时会出现发热、食欲不振、恶心呕吐等症状；做妇科检查时子宫会变得更软；超声检查显示子宫中可能存在残余物质。需要立即到正规的医院进行清宫手术，同时还要结合新生化颗粒、益母草颗粒、头孢类药物进行调理。
患者饮食要定时定量，不能暴饮暴食，忌食辣椒、麻椒、生葱、生蒜等刺激性食物，注意经期及性生活卫生。
药物流产后宫腔里如果有残留物，不清宫可能引起大出血或者宫腔内感染，导致出现宫腔粘连。如果是小的残留物，我们可以吃中药进行调理，将残留物排除。如果是大的残留物，通过中药不能将其排出，患者会出现阴道持续性的流血，还会伴有宫腔里面的感染，以及盆腔附件等部位的感染，对女性来说是非常不利的，患者会出现发烧、腹痛、阴道持续性流血等不适的症状，严重的时候会出现头晕、心慌、气短等非常严重的并发症。建议：在手术之后也要注意保养和抗菌治疗，否则也有可能会导致患者因为术后感染，损伤到正常的生育功能，导致各种生殖器官炎症的产生。
一般情况下，药物流产在服用完两种药物后的2-6小时可以排出孕囊。
通常，药物流产需要服用米非司酮片、米索前列醇片这两种药物来促进孕囊排出，从而终止早期妊娠。女性需要服用完米索前列醇片后的2-6小时左右来将孕囊排出。药物流产，在妊娠囊排出之后，子宫腔内增生的子宫脱膜组织并不能同时排出，需要在妊娠囊排出后的一周左右，才会逐渐将坏死、脱落的子宫脱膜组织排出体外，所以，药物流产后的出血时间相对较长，出血量相对较多。
一般情况下，药物流产没流干净指药物流产未完全排出妊娠组织，这种情况可能会来月经。如果妊娠组织和宫腔粘连较紧，则可能在药物流产时未完全排出。而子宫内膜在卵巢周期性分泌雌激素和孕激素的作用下，仍然会周期性脱落、出血，导致月经来潮，此时，残留的妊娠组织可能会和月经血一起流出阴道。患者可以观察月经血种是否存在组织物，必要时可以把组织物送到医院进行化验，明确是否存在药物流产未完全排出妊娠组织的情况。