平时积极锻炼身体，增强体质，能增进和改善肛门部血液循环，使局部的抗病能力提高，能预防感染的发生，一旦发生肛门直肠周围感染，应及早到正规的医院诊治，并采用有效的抗感染措施，包括全身及局部的治疗，可防止炎症蔓延、扩散，切勿轻信游医成所谓“祖传”的宣传而延误诊断及治疗。
肛周囊肿主要是由于肛门周围的皮肤发生感染后而形成的囊肿。在刚开始的时候，症状比较轻的时候可以服用超声速来进行治疗，或者是采用坐浴的方式来减少脓肿。如果囊肿已经有肿液就要采取手术的方式来进行治疗。
肛周囊肿形成早期，可采用抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗的方法来进行治疗。也可以采取手术的方式对囊肿处进行切开引流。
及时治疗肛周脓肿。一些浅表肛周脓肿可通过抗生素治疗、热水坐浴和局部理疗消除。然而，大多数病人需要手术切开脓肿，充分引流脓肿，并防止其持续蔓延，以减轻疼痛和其他症状。肛肠脓肿伴肛瘘必须通过治疗肛瘘来治疗。
肛周囊肿应该注意自己的习惯，要注意预防方法而且要注意处理事项，这种疾病的出现主要跟感染有关系，出现了感染之后，容易导致疾病严重，积极防治其他肛肠疾病，避免和减少肛周感染，脓肿和肛瘘的发生。