症状有：后尿道、会阴和肛门处坠胀不适感，下蹲、大便及长时间坐在椅凳上胀痛加重。放射性疼痛：慢性前列腺炎的疼痛并不止局限在尿道和会阴，还会向其附近放射，以下腰痛最为多见。另外，阴茎、精索、睾丸阴囊、小腹、腹股沟区、大腿、直肠等处均可受累。
通常有性交中的阴茎头或者是射精的时候的腹股沟绞痛、包皮的刺痛、射精之后的会阴以及腰骶部酸痛，以及射精后排尿的时候尿道灼痛等几种疼痛的症状产生。阴茎受到感染而引起的疼痛，可以用抗生素进行治疗；或者抗菌消炎，如果是受到刺激导致的疼痛，那么只要有充分的休息就可以使得症状得到减轻。
各种外伤、蚊虫咬伤、丘疹或表皮外伤。性交过度。生殖器皮肤感染。前列腺炎常引起阴茎疼痛，可能因为阴茎受到感染或受刺激导致。尿道炎和淋病主要通过性行为传染产生疼痛症状。
阴茎痛要针对引起阴茎疼痛的原发疾病进行治疗。如果由于阴茎感染引起疼痛，可以用抗生素进行治疗。如果因为受到刺激导致阴茎疼痛，只要充分休息就可使症状缓解。阴茎疼痛主要指阴茎表面或内部疼痛，有些男性在第一次性交后会感到阴茎疼痛，可能是阴茎在勃起后大量充血，血液回流不充分，造成性交后阴茎短时间胀痛。
可出现糜烂及溃疡，并且具有带有特殊气味的黄色脓性分泌物。严重者可发生阴茎头坏死。部分患者在急性期后出现尿道粘连和狭窄，导致排尿困难。反复感染可使阴茎或包皮的头部变厚。由于长期刺激包皮垢，阴茎头也可能发生阴茎癌。