听从医生的指示治疗毛囊炎比较好，能够改善症状。
如果是细菌感染所造成的，一般需要使用莫匹罗星软膏或者是夫地西酸软膏进行治疗，如果是真菌感染所造成的，通常需要使用抗真菌的药物，比如酮康唑乳膏或洗剂，也可以使用特比萘芬乳膏和益康唑乳膏。
治疗的过程当中需要多注意局部皮肤的清洁，不要与他人共用个人物品。
治疗毛囊炎应该及时的去医院检查，对症治疗。因为是细菌感染后造成的，要保持局部的干燥卫生，避免用手去挤，避免搔抓。可以局部热敷，用消毒水消毒，涂上药膏控制感染。在治疗和恢复期间禁止房事，以免交叉感染。
患者有毛囊炎，可以通过药物治疗、远红外线照射等方式进行治疗。
1、药物治疗：毛囊炎是常见的毛囊炎症性皮肤病，患者可遵医嘱使用抗菌药物进行治疗，常用药物有莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等。
2、远红外线照射：患者有毛囊炎，可通过远红外线照射进行治疗。该方法主要利用热光源所产生的不可见光线，作用于局部，使局部血管扩张、血流加快，促进局部新陈代谢，并加速组织的再生能力，从而提高人体抗感染能力，起到治疗疾病的效果。
毛囊炎后背的治疗，需要根据毛囊炎的轻重程度不同来选择不同的方法。如果毛囊炎很少，又都比较小，可以使用外用的抗生素药膏。如果毛囊炎比较多，总是复发，需要加用口服药。
中医治疗毛囊炎会根据每个人不同的体质进行辨证的治疗，一般主要有湿热体质与阴虚体质，可以根据这两种体质进行治疗。毛囊炎可以服用中成药，主能够起到很好的祛湿作用，从而抑制荨麻疹的症状。也可以使用外敷药物。中医治疗毛囊炎也十分讲究个人的清洁卫生，要保持皮肤的清洁，要尽量减少外物对皮肤的刺激，保持良好的生活习惯。
每个人患有毛囊炎的情况不一样，要先早日远离毛囊炎的困扰还是要在医生的建议下合理的用药，避免其他并发症的出现，治疗或控制毛囊炎，局部以杀菌、消炎、干燥为原则，轻度可外用消炎药、药水等，较严重可口服药物治疗。