主要的原因是包皮过长或者是包茎。包皮过长、包茎的上皮有分泌物积存在包皮和龟头之间，长期积存潮湿摩擦，导致细菌的生长，也可能与平时的情绪不稳定、熬夜、烦躁、抑郁，或进食油腻、辛辣食物过多，烟酒过度，导致局部的抵抗力下降而致病细菌增多，毒力增强引起了龟头皮肤的炎症性改变。
女性是不会有龟头糜烂得。男性生殖器疱疹的原因还有性传播和母婴传播，有的小孩刚生下来就是生殖器疱疹病人。患了生殖器疱疹的朋友都会遇到一个问题即久治不愈，困扰着病人正常的生活。生殖器疱疹在治疗后几个月内就会康复，但有些人患病已经几年还是治不好，反复发作。
引起龟头炎的病因较多。如感染了白色念珠菌、滴虫、或其他细菌引起，也可以是由于包皮过长，清洁不够，包皮和龟头之间的不洁之物，即包皮垢，便会堆积起来，刺激局部的包皮和粘膜发生炎症。
龟头糜烂多是由于卫生不好，炎症感染等引起，应该来说去当地医院检查下，在医生的嘱托下，进行积极治疗，服药期间不吃辛辣刺激的食物，平时要注意个人卫生，多喝水，不要有性生活，以免交叉感染。
反复龟头糜烂是以下原因，其病因多见于包皮过长、包茎、手淫、外伤、感染等，导致角化上皮脱落和腺体分泌，为其他细菌形成良好的繁殖条件，引起炎症，其临床表现多见于局部瘙痒、红肿、糜烂、甚至成溃疡，出现分泌物、有异味等，严重情况下可以有发热、寒战全身症状，甚至阴茎肿大、疼痛等。及时到医院做分泌物等相关的检查后遵医嘱治疗。
多考虑为包皮过长炎症反应出现的这一种龟头炎症，出现糜烂溃疡的情况。这种炎症可以是感染性的和非感染性的，临床上以感染性的包皮龟头炎较多见。感染性的糜烂性龟头炎常由于不洁夫妻生活，感染了白色念珠菌、滴虫、衣原体、支原体、淋病双球菌或其他细菌引起。