自身免疫性甲状腺炎，这种疾病没有非常有效的治疗，目前常用药物治疗来减轻甲状腺损害。亚急性甲状腺炎，这种甲状腺炎是自限性疾病，这种疾病是甲状腺细菌感染造成的，需要该药物治疗，如有脓腔可以考虑引流。
一般情况下，甲状腺炎的治疗方法有以下方法，具体内容如下：
1.自身免疫性甲状腺炎，目前尚无有效的药物，主要可硒酵母缓解甲状腺损伤。
2.亚急性甲状腺炎，是一种自限性的病症，可以在医生指导下口服布洛芬、双氯芬酸钠等非固醇类的药物，如果出现症状，可以口服泼尼松。
3.化脓性甲亢是由甲状腺的细菌感染引起的，一般要用到抗生素，如果出现脓腔，建议进行引流术。其他的甲状腺炎也会导致甲减的发生，都需及时的进行针对治疗。
甲状腺功能减退的治疗目前以补充甲状腺激素为主，同时需注意以下几点：
1、甲状腺激素补充因人而异，需要个体化。
2、应从少量开始逐步增量。
3、定期复查甲状腺功能。
4、孕妇应按照医生指导用药。甲状腺的治疗方法比较简单。甲状腺分泌激素缺乏，主要是替代治疗。最常用的是左甲状腺激素片，根据甲状腺功能情况逐渐调节剂量直到满足身体需要。甲状腺功能是促进代谢的激素，机体长期缺乏时，代谢能力无法适应，必须从少量开始，过多的剂量会导致心率过快、心悸。使患者逐渐适应，达到能够适应的状态。
进行免疫调节的治疗，比较常用的药物是夏枯草口服液或者是硒酵母胶囊，这两个药物主要调节甲状腺细胞免疫，降低甲状腺球蛋白抗体、甲状腺过氧化酶抗体的水平，减少甲状腺对细胞的损伤。
通常情况下，产后甲状腺炎治疗方法有药物治疗。
甲功七项及甲状腺超声检查可以了解甲状腺炎的主要病因。如果是由病毒感染引起的急性和亚急性甲状腺炎，可以口服抗病毒口服液，病毒唑等，同时还可以联合吲哚美辛或者布洛芬消炎、消肿等。对于亚急性自身免疫性甲状腺炎，可以选择使用强的松。如果是慢性甲状腺炎合并甲状腺功能低下，可以口服左甲状腺素片等，如果没有甲减，可以暂时不用药。此外，产后甲状腺炎一般不会出现明显的临床表现，可以先观察。
治疗甲状腺结节的方式包括手术治疗、微创消融和药物治疗等。
大部分情况下，可以通过手术来观察甲状腺的良性结节。良性结节压迫症状，如有压迫感、有压迫感、有呼吸困难、压迫食管引起的吞咽困难、压迫喉返神经、压迫喉返神经、声音嘶哑、声带麻痹、良性结节、突出的良性结节、突出的胸部等。甲状腺恶性结节，通常需要做外科手术。有淋巴结转灶的患者也要进行颈淋巴结的清理。