精子畸形率的原因有泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张、应该查明引起精子畸形率高的病因，再针对原发病的治疗，这样才能提高精子的存活量。选择正规专业的医院，进一步检查明确病因针对性治疗。在生活上注意饮食禁忌辛辣刺激，戒烟酒，多饮水，多锻炼身体，保持愉悦的心情，这样对病情的康复有着重要的作用。
精子畸形应该到正规的家三级医院治疗：由生殖道感染引起者，可进行抗炎治疗，由内分泌异常所致者，则给予内分泌功能调整，对病患，应考虑手术治疗。2、治疗高畸形率精子症所致不育症应根据引起畸形精子的原因，消除不利因素（药物、放射线、高温、酒等），针对病因进行治疗。
精子畸形主要是由于生活环境影响、男性缺锌和蛋白质等所导致的，所以只要远离不良的生活环境影响，及时补充锌和蛋白质就可以改善，临床治疗上主要是通过口服育之緣片来改善的。治疗期间注意戒烟酒，坚持每天运动，多吃蔬菜水果。
如流行性腮腺炎、性传播疾病等。男性精子异常、弱精、死精症会导致不孕不育，要及时到当地正规的三甲医院进行检查与治疗，因为只有正规的医院才会更加的安全，治疗费用也比较公正合理。
平时可以适当吃点鳝鱼、山药、苹果等食物，对改善精子质量有一定效果。注意做好日常的饮食和作息调养，定期复查。不要吸烟喝酒。人的精子三个月循环一次，坚持三个月的锻炼身体和吃番茄红素、维生素。
改善精子畸形需要补充蛋白锌、蛋白硒和蛋白质。可以服用三个月的药物口嚼片来补充蛋白锌、蛋白硒和蛋白质，蛋白锌蛋白硒可以提高精子活力和精子质量，改善精子形态，而蛋白质辅助配合能够促进精子生成，提高男性免疫力。