亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。
亚急性甲状腺炎可以怀孕，但是在急性期最好不要怀孕，因为亚急性甲状腺炎是由病毒感染引起的。不是感染了病毒的最好时机。亚急性甲状腺炎分为甲亢期、甲减期和恢复期，在甲状腺功能恢复后，身体状况良好的时候进行妊娠，对孕妇和胎儿都是有益的。也有少数的亚急性甲状腺炎，不能够被治愈，此时有可能会遗留永久的甲减，但是如果遗留甲减的时候，只需要补充甲状腺激素。
亚急性甲状腺炎如果症状轻只需口服药物治疗即可，如果症状重颈部疼痛发热明显，就需要激素治疗，一般需要2周以上可以考虑减药。减药应慢，减药快易复发，需要在医生指导下根据辅助检查用药。
可以用激素进行治疗，通过激素治疗应该是可以达到控制临床症状的目的。如果患有亚急性甲状腺炎，主要的治疗方法就是可以通过应用，非甾体类的抗炎药或者是糖皮质激素进行治疗，同时对症用药进行处理，都是可以完全恢复的。
急性甲状腺炎可以通过药物、手术等方式进行治疗。
急性甲状腺炎的治疗原则是：抗感染和手术介入，在早期确诊后，首先要选择广谱抗生素进行经验治疗，等穿刺物病原体的培养有了效果，再进行抗生素的调整。一般来说，如果合并有一些基本的疾病或者先天性畸形，很难控制感染，需要在2-3个星期内使用抗生素，在脓肿形成后进行抗感染治疗，同时还要进行排脓。
一般情况下，亚急性甲状腺炎可以通过日常护理、使用药物等方式进行治疗，具体内容如下：
亚急性甲亢是一种自限性的病症，哈尊和平时注意保暖，避免感冒。少数病人出现了明显的临床表现、炎症面积比较大，如果出现了明显的症状，可以通过一些药物来进行治疗，以防止出现长期炎症。可以口服阿司匹林、布洛芬、吲哚美辛等非甾体抗炎药物。如果疼痛剧烈、高热不能减轻，或炎症范围扩大，可以服用糖皮质激素，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。