急性甲状腺炎可以通过药物、手术等方式进行治疗。
急性甲状腺炎的治疗原则是：抗感染和手术介入，在早期确诊后，首先要选择广谱抗生素进行经验治疗，等穿刺物病原体的培养有了效果，再进行抗生素的调整。一般来说，如果合并有一些基本的疾病或者先天性畸形，很难控制感染，需要在2-3个星期内使用抗生素，在脓肿形成后进行抗感染治疗，同时还要进行排脓。
亚急性甲状腺炎等，一般数周或数月后减轻，病程6-12个月，反复发作者甚为罕见。
一旦出现了慢性化过程，则会对患者带来很大的危害，严重时还可导致死亡。如亚急性甲状腺炎反复发作，有可能是糖皮质激素减量过快，停药过早，此症若症状较轻微，可应用非甾体类消炎止疼药，疼痛症状好转即可，如仍伴发热，血沉升高十分明显，可再应用糖皮质激素，以改善症状。对于亚急性甲状腺结节或囊肿者，一般不建议进行治疗。待血沉恢复正常后，再逐步减量，总疗程必须超过6-8周，如停药太快，太早，极易又导致亚急性甲状腺炎的复发。因此对于已经发生了亚急性甲状腺炎的患者，应该尽早进行治疗和护理，避免造成不必要的损失。亚急性甲状腺炎为病毒感染变态反应性炎症，发病前，许多病人都有上呼吸道感染病史。
治疗亚急性甲状腺炎主要通过药物治疗，治疗发热、颈部疼痛等症状。体温高于38.5℃时可进行退热处理，如颈部疼痛、耳颞部疼痛等，可加用非甾体类抗炎药进行止痛治疗，但如果单纯使用非甾体类抗炎药无法控制病情时，排除激素使用的禁忌症，可适当加用激素药物的治疗，具体用药需要在医生的指导下进行，不可盲目用药，容易引发不良反应。
急性甲状腺炎是甲状腺的急性化脓性感染，又可以称为急性化脓性甲状腺炎，常见症状为高热，出汗，喉咙痛，吞咽困难等，还会引起甲状腺的局部肿块，皮肤会发红，发热。急性甲状腺炎主要是抗感染治疗，在发病初期，应该选择消炎类药物进行治疗。
亚急性甲状腺炎往往能在一个月内逐渐恢复正常。
具体分为三个阶段。第一阶段，亚急性甲状腺炎可引起病毒感染引起甲状腺大量破坏、甲状腺激素大量释放、早期甲状腺功能亢进症症状，表现为心悸、出汗、消瘦，检查单呈现甲状腺功能亢进症。此时忌吃碘，即不吃海产品，不使用任何抗甲状腺药物。随着时间的延长，进入第2阶段，即临床缓解期，往往最长约1个月左右临床症状消失，化验单逐渐显示患者生命体征平稳，血沉正常。一些患者可以进入第三阶段，即合并亚甲炎和甲减，患者乏力、嗜睡、体重上升，化验单出现甲减。此时，根据TSh的情况，一生都需要用甲状腺激素片替代治疗。
亚急性甲状腺炎不一定是失眠。
这种情况是最常见的呼吸道感染，可以使用抗病毒药、消炎药等治疗，治疗后也可以改善改良性不好的生活习惯，尽量不要吸烟，不要喝酒，不要喝碳酸饮料，要多吃清淡的食物，或者多吃新鲜水果。因为甲状腺功能正常，所以不觉得不舒服，不吃药就能治疗。只要不多吃碘含量高的食物，定期复查就可以了。这种病不会导致失眠。
