卵巢囊肿根据大小、位置、性质不同，治疗方法不同。一般以手术治疗为主，要看是否恶性，囊肿的部位，体积，大小和生长速度。如畸胎瘤，B超、平片检查可发现牙齿、骨头等特殊结构，肿瘤超过3-4cm需要进行手术处理。其它囊肿、肿瘤并无此典型表现。
卵巢囊肿的消除应该视病情而定，小于五厘米又没有查到明显的肿瘤指证的病人，多为功能性囊肿，可以密切观察，2至3个月检查一次，视病情情况采用药物治疗，中药西药都有比较明显的疗效，肿囊肿直径大于五厘米，则多为卵巢肿瘤，对此应该采用手术治疗，卵巢囊肿的危害相对比较大，因此必须认真对待，积极治疗，可以到正规医院诊治。
卵巢囊肿平时要注意生活要有规律，不要过度熬夜，多注意休息，避免劳累。要劳逸结合，保持好的心情，不要生气。也需要多注意卫生。在日常饮食中，多摄入蔬菜瓜果，保证维生素E、维生素B2的摄入量，坚持进行适当的体育锻炼。
卵巢囊肿一般需要手术治疗，手术后一般可能需要6到8周左右时间就可以完全恢复了，由于卵巢囊肿的产生与雌激素分泌过多有一定的关系，所以日常生活中一定要注意科学饮食，形成良好的生活作息，防止精神压力过大，而尽可能的避免内分泌紊乱的发生，从而导致复发。
多食用高蛋白、富含维生素食物，避免进食含高胆固醇食物，如鸡蛋、鸭蛋、猪肝、猪肾、猪脑、鸡肝、鸡肾，可从流行病学角度上降低卵巢囊肿发生。应以营养、均衡、清淡饮食为主，避免食用油炸、腌制等易致癌食物，避免食用辛辣刺激食物，避免饮酒，避免食用羊肉、虾、黑鱼、花椒、生葱等发性食物。
