一般采用的传统手术切除囊肿，痛苦大、潜在风险高，费用也高，恢复缓慢，易感染，对工作、学习和生活有一定影响，放疗、化疗易损伤正气及机体正常细胞，使病人免疫功能降低，痛苦较大，费用也大。随着现代医学的进步传统手术治疗已渐渐淘汰，反而被微创治疗技术所代替。
当地的三甲不同类型的卵巢囊肿，有不同的治疗方法：真正的卵巢肿瘤，要根据肿瘤的性质及组织分类进行特异性治疗；如果是恶性肿瘤，要应根据肿瘤分期选择不同的治疗方法，常见有手术切除等。
卵巢囊肿应该去正规的三甲医院治疗，不要去一些小的门诊或者是药店，卵巢囊肿治疗方法，只有卵巢囊肿非常严重了，才考虑手术治疗，如果是因为身体内分泌失调导致的卵巢囊肿，可以中医治疗。
卵巢囊肿不艾灸来治疗，卵巢囊肿的病人通常需要定期复查妇科彩超，因为卵巢囊肿分为生理性囊肿以及病理性囊肿，如果是生理性囊肿，月经干净之后多数情况下可以消失。如果年龄比较小，可以选择卵巢囊肿剥除。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
妇科专家认为，卵巢囊肿这种与内分泌机能失调、促黄体素分泌不足、排卵机能受到破坏有关的囊肿，单靠西医药物控制治标不治本；手术切除有50%以上的复发情况，中医治疗目前认为是比较可靠的治疗方法、无毒副作用、不易复发，但缺点是疗程长。
