性功能障碍应加强对性知识的引导，消除对性问题的忧虑和恐惧，纠正错误的性观念和性交方法，使夫妻的性生活协调一致。心理治疗强调个体化治疗，常用的有心理分析、厌恶疗法、全身脱敏疗法、家庭疗法等。主要通过性集中训练，使之逐渐适应，熟悉性交过程，提高自己的性反应意识，充分享受性交的快感，减少对性交的焦虑和恐惧。在治疗过程中，另一方应避免性体验、性自尊和性幻想的不良刺激，避免有害的性吸引活动。耻骨尾骨肌训练对于骨盆底肌松弛或产后耻骨尾骨肌发育不全的妇女尤其有效。
根据每个病人的情况不同，会采取不同的治疗方法。从医疗角度的方法会有手术治疗，还有一些心理治疗，还有性教育，是出于现在对性问题的一个顾虑和担忧，所以要纠正错误的观念才能够使夫妻间的生活变得更加和谐。还会有物理治疗，如用电动的按摩器刺激男性的生殖器官。
手淫不宜过度频繁，每周1-2次即可。手淫时要在私密，舒适的环境，避免动作粗暴，充分润滑，以免手淫过度引起早泄可能。如有包皮过长，行包皮环切术。把精力跟注意力转移到工作跟体育锻炼上。
性功能障碍的治疗关键是在于是否对症，不对症的治疗，比较常见的治疗方案有药物治疗，物理仪器治疗甚至是手术治疗，但是不管采用哪种治疗方案，要先到医院做个全面的检查之后，再做规范的治疗。
一般情况下，前列腺性功能障碍可以通过药物治疗、日常护理等方式缓解相关症状，具体内容如下：
1.药物治疗：如果患者出现了前列腺性功能障碍的情况，患者可以在医生指导下使用前列康片、前列舒通胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗，以缓解症状。
2.日常护理：在治疗过程中，患者应注意日常护理，要避免熬夜，不要食用辛辣刺激性的食物，可以多运动，以增强体质，提升性功能。此外，患者要避免熬夜，避免频繁发生性行为。
性功能障碍治疗主要包括以下几个方面：性功能障碍药物治疗：针对不同的性功能障予以相应的药物治疗；物理治疗：如不射精可进行电动摩擦治疗，不兴奋可进行振动治疗；手术治疗：如包茎、包皮过长进行包皮环切术，器质性阴茎勃起障碍可以假体植入治疗等。