肾结石肾囊肿囊内有钙化是肾钙化灶，钙沉积在骨骼以外称钙化灶，是疾病愈合的表现，不排除是肾结核，结石等导致的，进一步检查确诊，主要是由于肾以前发生过慢性炎症，炎症机化，钙化，这是一系列变化，如果钙化灶不大，没什么问题的，无需特殊处理，如果有肾结石按照肾结石的治疗原则进行治疗。
双肾囊肿伴结石，可以使用穿刺抽液手术进行治疗。肾囊肿是肾脏的一种良性的结构异常，一般小于四公分的囊肿，定期复查即可。身体出现不适时，要及时去医院进行检查治疗。注意休息。
不属于是肾结石的，但是有囊壁钙化现象就要注意了，因为有了钙化灶之后会演变成结石的，一般不需特殊处理，肾囊肿伴囊壁钙化灶可能是囊肿壁有钙质沉积造成，不需特殊治疗了，平时一定要多喝水。
肾囊肿加结石有些严重，在有双肾囊肿而且伴有结石的情况下，要看囊肿和结石的大小，如果囊肿大于五cm的情况下，就是要去做手术来进行切除了，而结石要看具体所在的部位和结石的大小。
针对肾结石，肾囊肿的病人，具体怎么办还是要根据具体结石的病情以及囊肿的病情来决定具体的治疗方法。
要给患者做彩超，CT及其他检查以明确肾结石具体情况和肾囊肿大小及其他病情。在这些方面都要根据患者实际的病情进行具体的分析，这样才能够制定出相应的方案。通常情况下，肾结石如体积较小，梗阻轻者可采用某些药物处理，许多患者都能以保守方式排出结石。如结石的体积较大，也许有必要用手术方法清除肾结石。在临床中通常会选择肾穿刺取石和经皮肾镜取石术这两种方式。肾囊肿通常都属于良性疾病，如体积小患者无症状，然后就能定期观察了，若囊肿超过四厘米，或认为囊肿可能恶变，则应积极手术。
肾结石加肾囊肿可能严重，也可能不严重。
一般来说，肾结石可以是很重的，也可以是轻的，比如肾囊肿，如果体积很大，并不会太严重。囊肿有可能是因为囊肿有炎症，或是有很大的。一些肾脏脓疡伴有炎症，会有高烧，高达39~40℃，重则会导致感染，危及性命。肾结石由于长期的反复炎症刺激，还有一些肾结石会发展成肾癌，通常是鳞癌，但手术和其它的疗法对疗效都很低，而且愈合非常不好，因此肾结石合并肾囊肿并不是很严重。这种疾病要看患者的具体病情，如果出现了肾结石或者肾囊肿，一定要到正规的医院泌尿外科进行检查。