医学认为感染是疾病的主要原因。肛周脓肿可由肛裂、痔疮、肛窦炎、肛周皮肤滤泡性汗腺炎、肛周皮肤病等感染引起。某些疾病，如溃疡性结肠炎、再生障碍性贫血、全身营养不良，使身体虚弱，降低抵抗力，并诱发肛周脓肿。一般也会见到因为肛门直肠手术引起的感染，从而形成直肠周围脓肿。尿道术后感染、尾骶骨骨髓炎术后感染、产后会阴破裂缝合后感染等手术都可能引起脓肿。
肛门脓肿主要来自于肛腺感染，可能与自身免疫力弱，解剖结构异常，排便习惯不良有关系，大便次数过多，大便不成形，或者是大便干燥，都可能是肛周脓肿的诱发因素，一旦诊断明确，肛周脓肿形成时应当及时手术治疗。
可以使用一些药物进行治疗。肛周脓肿是发生于肛门、肛管和直肠周围的急性化脓感染性病，属于细菌感染，要给予抗炎治疗，脓肿成熟后可切开引流，给予营养丰富的食物，可多吃高蛋白，及富含维生素的食物，避免吃辛辣刺激性食物。
肛门脓肿严重。因为发病比较急，疼痛比较厉害，短时间内可以沿着肛周的脂肪间隙蔓延。如果是慢性的肛周脓肿，一般形成脓肿会有一个过程，疼痛不是特别厉害，全身症状不是特别重。
肛门脓肿的症状。肛门脓肿属于肛周的一种急性感染，多继发于肛腺的炎症反复发作不愈，病人会有明显的肛门疼痛伴有发热，排便时也会导致症状的加重，深部的脓肿还会有明显的寒战和乏力，化验也会表现为血常规白细胞和中性粒细胞比例明显增高，查体在肛周表现为皮肤充血水肿的炎症表现，局部充进行穿刺可以获得脓液，早期诊断应该及时的选择手术切开引流。