口腔溃疡的病因较多。有的是因为遗传因素导致儿童容易反复发生口腔溃疡。除此以外，最主要的是因为口腔黏膜的屏障功能下降。如果微量元素的摄入较少，缺乏多种维生素，会引起屏障功能下降，产生口腔溃疡。如果外界食物的渗透压过高，酸碱性过强，也会导致口腔黏膜的屏障功能破坏。
可以适当的补充维生素和微量元素锌，同时服用药物治疗。注意清淡饮食，避免辛辣刺激食物和油腻饮食。这期间注意保持口腔清洁，常用淡盐水漱口，生活起居有规律，保证充足的睡眠。
导致反复口腔黏膜溃疡的病因，包括全身因素和局部因素。复发性口腔溃疡又称为复发性阿弗他溃疡、复发性口疮。病因复杂，存在明显的个体差异，可能是多种因素综合的结果。全身因素包括全身性的疾病如糖尿病、内分泌功能紊乱、心脑血管疾病。局部因素包括创伤性因素以及局部的刺激因素如残根残冠的刺激。治疗主要是对症处理，辅助全身治疗。可以应用含服或者是局部涂敷，促进溃疡的愈合，减轻溃疡的疼痛。建议到五官科检查就诊，平时要养成良好的生活习惯，少食辛辣食物，多吃水果蔬菜，补充维生素，适当进行运动，保持较好心态，保持口腔的清洁卫生。
缺乏多种维生素及微量元素。多见熬夜上火，或见于一些免疫系统性疾病，精神压力过大，遗传性疾病。多吃一些富含维生素及微量元素的食物，缓解工作压力，增强身体抵抗力，保持愉悦心情。
复发性口腔溃疡的发病常常和病毒感染、细菌感染、消化系统疾病及功能紊乱、内分泌变化、精神状态神经因素、遗传因素及免疫功能的变化有关。口腔溃疡的发生与胃溃疡、溃疡性的结肠发炎有关，同时一些女性口腔溃疡可能与月事周期有关，在精神状态紧张、睡眠不佳等情况下，也容易发病。
孩子经常口腔溃疡，应该检查是否缺乏维生素B族或者是否有贫血，可以根据情况补充。如果缺乏维生素B族可以补充动物的肝脏、蛋类、奶类、新鲜的水果和蔬菜、豆类和粗米面等。