乙肝大三阳和小三阳的区别在于大三阳是e抗原阳性，小三阳是e抗原阴性。
乙肝大三阳指乙肝患者体内乙肝病毒的免疫指标即乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗体这三项为阳性，指标可提示患者体内病毒的复制是否比较活跃，但却法知晓该细胞是否受到严重损害。患者在去医院进行检测时，如果表面抗原乙肝e抗原和核心抗体的检测都是阳性，也就是乙肝五项检测中135呈阳性，则是大三阳。如果乙肝五项检测中，145都是阳性，我们则可以称其为小三阳。大三阳体内的乙肝病毒会呈现较活跃的复制状态传染性也是比较长，小三阳的肝功能长期较正常，称为稳定性的小三阳，传染性较低。肝功能检查时发现反复异常，则为不稳定性的小三阳，传染性较强。
乙肝大三阳转小三阳的患者有很多，中国大约9千万的HBV感染者，而慢性HBV患者约2千万，而HBV患者约7000万，肝功能正常的大三阳患者约为7000万，而肝功能正常的小三阳患者则更多，而这些肝功能正常的乙肝小三阳患者，则是自发性转阴。一般来说，30岁之前，大部分人都可以从大三阳转为小三阳，但是30岁之后，如果还做不到，就会有肝炎、肝纤维化、肝肿瘤等并发症，需要根据具体的情况进行分析，大三阳患者在服用干扰素的时候，如果有干扰素的适应症，那么就有可能转化为小三阳。
乙肝小三阳是指乙肝表面抗原阳性，e抗体阳性，核心抗体等阳性，即小三阳。而表面抗原阳性，e抗原阳性，核心抗体阳性，则称为大三阳。
大三阳的病毒载量比较大，有八次方甚至十次方，小三阳病毒的载量一般都比较低，比大三阳病毒要低一些，传染性也比较弱。不同的是，不管是小三阳还是小三阳，都要定期监测肝功能，一旦发现肝功能出现问题，要及时治疗，避免出现肝炎反复发作、肝硬化、癌变等不良反应。
在乙肝两对半化验单中，乙肝小三阳是145阳性，乙肝大三阳是135阳性。乙肝大三阳提示乙肝病毒数量多，病毒复制活跃，传染性大。乙肝小三阳提示乙肝病毒数量相对较少，病毒复制活跃称程度低，传染性小。所以乙肝大三阳比乙肝小三阳要严重些。但是针对乙肝大三阳患者也不要担心，目前有恩替卡韦、替诺福韦酯等抗病毒药物，90%能使大三阳转变为小三阳的。
乙肝大三阳是指乙肝表面抗原、乙肝e抗原以及乙肝核心抗体的指标呈现阳性，小三阳是指除了乙肝表面抗原和乙肝核心抗体，乙肝e抗体呈阳性。大三阳患者的乙肝病毒的复制能力要强，传染性要更强。
乙肝大三阳和小三阳区别表现在以下几方面：
乙肝大三阳包括三个项目乙肝表面抗原、乙肝E抗原以及乙型肝炎核心抗体阳性。乙肝小三阳是指乙肝表面抗原、乙肝E抗体以及乙肝核心抗体阳性。大三阳具有很高的感染率，而乙肝小三阳的感染率一般要低，而大多数的乙肝三阳患者，都会有乙肝E抗原的血清学转化，乙肝E抗体的出现表明其感染率会降低，而乙肝的复制能力也会降低。