肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作，需要手术治疗。肛瘘的手术方式很多，手术是减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。
肛周囊肿是因为肠道细菌进入肛窦，引起肛腺感染，蔓延至肛周间隙。多食果蔬，多吃富含膳食纤维的食物饮食上应以清淡并含较多纤维素的食物为宜，食用有清热解毒的食品，能缓解肛门局部肿痛、渗出等症状。
得了肛周囊肿要去相关机构进行检查治疗。可以多吃新鲜蔬菜水果补充营养，也可以通过一些食补，比如鸽子汤、黑鱼汤等补充元气。但是在饮食上是需要忌口的，就是辛辣刺激食物不能吃，还要戒烟戒酒。
越早手术越好，因为这与医生的技术和经验有很大关系，所以建议一定要到正规的肛肠专科医院手术治疗，建议注意饮食规律，不过饱过饥，不食用生冷寒凉的食物，生活中可以多增加姜枣，扁豆等具有健脾功效的食物。
肛周囊肿早期服用清热解毒的中药治疗有一定的效果。肛周脓肿是肛门周围软组织间隙的一种化脓性感染，处理不当容易形成肛瘘。拔罐疗法，即在肛门周围肿突出部位技罐10-20次，日3-4次，十五次一疗程。有效率是90%，也可以中药治疗，但需要辩证。
肛周皮脂腺囊肿及时治疗不会形成肛瘘的，皮脂腺囊肿俗称粉瘤，就是毛孔堵塞导致分泌的油脂类东西堆积形成包块疙瘩。一般容易导致感染发炎。建议在没有感染的时候手术切除以绝后患。肛瘘是肛门周围局部组织感染发炎形成脓肿，正确治疗不会形成肛瘘。
