多囊肾是一种遗传性疾病，根本是基因性疾病，无法从基本上治好。多囊肾常伴有多囊肝，多囊胰腺，有部分人伴有蛛网膜下腔囊肿。主要表现为高血压，腹胀，很多人有血清肌酐升高。主要是对症治疗，降压，排毒治疗是主要的治疗方法。如果多囊肾囊肿多大，出现症状，可以采取外科治疗。
多囊肝、多囊肾，治疗上主要以对症治疗为主，比如多囊肝、多囊肾的患者，如果出现了血尿，患者早期卧床休息，合并感染积极的抗感染治疗。如果囊肿过于巨大，而产生了压迫的症状，比如多囊肾出现腰部的疼痛，肝囊肿出现上腹部的疼痛，这时如果有单个的囊肿比较巨大，可以行去顶减压术，来减轻患者的这种疼痛不适。出现了肝功能的异常或者肾功能衰竭，对症的使用保肝类的药物、保肾降糖类的药物对症治疗。
保守治疗，一般多囊肾处于早期，若出现相关临床症状，可做对症处理，如减少囊液分泌、降低血压或者采用一些结合的药物，来缓解患者的症状；手术治疗，多采用囊肿去顶减压术治疗，即把肾脏囊肿单独打开，降低对周围正常肾组织的压迫，保护正常肾组织的功能。
食谱要采用低盐饮食每天2～3克食用盐为宜，少吃含钾、磷，饮食，要低蛋白、低脂肪饮食、多吃富含维生素与植物粗纤维饮食，可以做黄芪烧羊肉，扁豆薏薏米田鸡汤，熟地枸杞子炖鳖鱼汤等。
本身多囊肾总是属于先天性疾病问题，一般采用保守的治疗方式，肾脏一般是出现了，没有办法正常的清除体内的废物，给肾脏所带来的异常伤害，如果肾脏没有办法进入体内的废物会造成更严重的尿毒症等情况。对于治疗多囊肾疾病需要患者结合医生的专业治疗来进行诊断。