重症肌无力的治疗主要分为三部分，手术治疗，药物治疗，血浆置换。手术治疗，胸腺和胸腺瘤的扩大切除手术是公认的治疗重症肌无力的有效手段，术后症状完全缓解或部分缓解者可高达80%-90%，现在绝大多数重症肌无力手术都可以用胸腔镜进行微创手术。
眼肌型重症肌无力指肌无力症状局限于眼外肌，眼肌型重症肌无力任何年龄均可起病。针灸治疗取足三里(双)、隐白(双)，得气后留针，留针时在穴位用艾条温和灸15-20分，再于病侧上睑用梅花针反复叩刺，局部皮肤潮红后，在叩刺部位灸10分左右。
多数重症肌无力能治好，单纯眼肌型的重症肌无力用药物调理能治好，伴有胸腺瘤，甲亢等疾病可通过合理的治疗得到临床缓解，胸腺瘤需把胸腺或胸腺瘤切除，甲亢导致的自身免疫紊乱需用抗甲亢的药物。
胸腺切除是重症肌无力有效治疗手段之一。重症肌无力是一种由神经-肌肉接头处传递功能障碍所引起的自身免疫性疾病，临床主要表现为部分或全身骨骼肌无力和易疲劳，活动后症状加重，经休息后症状减轻。重症肌无力的发病原因分两大类，一类是先天遗传性，极少见，与自身免疫无关；第二类是自身免疫性疾病，最常见。
目前的医学水平无法完全的治疗重症肌无力这种疾病，但是可以通过药物控制病情。重症肌无力症治疗时间要根据病情的具体情况。这属于神经肌的疾病引致肌肉颤动、软弱及容易疲劳。这是一种自我免疫系统的紊乱。
胸腺切除手术，但是胸腺切除手术也有适应症，主要是用于有胸腺异常的人，是适用于十六到六十岁之间发病的全身型没有手术禁忌症的重症肌无力患者，大多数患者在胸腺切除后，可以显著改善症状。另外有一些效果也比较明显，比如静脉注射免疫球蛋白，可以综合自身抗体，调节免疫功能。