治肛周囊肿大约需要7-10天的时间。多数需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。伴有肛瘘的肛管直肠周围脓肿，要治疗必须先处理肛瘘，局部可用中药的溶液坐浴，使会阴保持清洁。同时应用抗生素控制感染。
肛周脓肿是手术治疗。肛周脓肿是因为肛腺感染引起的急性化脓性疾病，如果不治疗会越来越严重，破坏后会形成肛瘘。总之，需要手术治疗。及时去手术处理的，不然以后变成复杂性就比较麻烦了。平时主要不要熬夜上火，保持大便通畅，不要辛辣煎炸油腻饮食。
肛周囊肿最多见的就是皮脂腺囊肿，或者是浅表的感染之后继发的囊肿，会有明显的肿物，或者病人出现排便异常，甚至排便不成形，排便困难；反复的刺激也会导致大便带血，进而影响到病人的生活或者工作。
首先做肛诊检查看一下脓肿的程度，如果脓肿很大，周围肿胀疼痛应该及时的手术彻底切开脓肿充分清理冲洗脓液引流才能很快好转的。除非很小的脓肿可以服用抗生素消炎。可以逐渐恢复正常的。
低位的肛周脓肿术后刀口完全愈合需要一个月左右，期间要经常换药，要安排好时间。一般是术后一周多要每天便后换药，以后可以隔天一次，再以后隔两天一次，间隔时间根据刀口愈合情况而定。以确保刀口顺利愈合，预防肉芽组织增生过长或者肛门狭窄等情况发生。