治疗女性排卵障碍，可以内分泌紊乱入手，对有合并有内分泌紊乱疾病的病人，还要接受内分泌紊乱的治疗，在内分泌状态相对良好的时期怀孕，可以减少流产率及孕期并发症的发生。或者加强黄体功能，部分排卵异常是由黄体功能不足所致的，也需要加强黄体功能。
排卵障碍疾检查是内分泌检查：在女性排卵以后，通常是在月经来潮前一周的时候进行抽血检查。B超卵泡监测：可以采用B超对卵泡进行监测，一般是在一个月经周期当中进行两到三次，可以推算出大概的排卵期，然后再进行进一步的检查。子宫内膜活检：取子宫内膜进行检查，如果子宫内膜有分泌变化的话，就说明是有排卵的。
可以吃酱油。注意膳食均衡，加强营养。可多食用含铁量丰富的食物，更年期患者应控制胆固醇摄入。养成良好的生活习惯，按时作息，按时按量服药，避免过度劳累。注意个人卫生，保持外阴清洁，勤换内衣物，防止感染。保持良好心态，消除对疾病的恐惧、焦虑。
以排卵障碍药物治疗为主，多选择激素治疗。给予止血、调整月经周期、促排卵治疗。正常的排卵需要完整的下丘脑-垂体-卵巢性腺轴的正常功能，其中任何一个环节的功能失调，或器质性病变，都可以造成暂时或长期的卵巢功能障碍，导致排卵异常。
排卵障碍是能治好的。排卵障碍的因素有，中枢神经系统性无排卵、下丘脑性无排卵、垂体性无排卵、卵巢性无排卵、多囊卵巢综合征等，找到因素，对症治疗。只要排卵正常对胎儿影响不大。需要去当地的正规的医院做个详细的检查，找到因素，是可以治疗好的。
不孕，排卵障碍可能会导致女性不孕。不孕是指正常性生活并未采取避孕措施12个月后未妊娠，排卵障碍或稀发排卵约占女性不孕因素的40%。月经失调和闭经排卵障碍也会影响正常月经，排卵障碍的较为直接的一个症状就是会发生月经失调和闭经。如果女性在18岁还没出现月经初潮，则为原发性闭经。如果曾有月经但停经半年以上称为继发性闭经。