高位肛瘘是指瘘管及其支管在肛提肌和肛管直肠环上方。手术是治好高位肛瘘的根本方法。如果手术中过度损伤肛直环会导致不可逆的肛门损伤，所以手术要充分保护肛门的核心结构“肛直环”。
部分肛瘘是可以不用手术的，忌食有刺激性的食物，辛热之品易使肠胃发作湿热，多食蔬菜水果，如苹果、香蕉、梨等；加强肠蠕动而通利大便，调整胃肠气机。宜食蜂蜜，有清热补中，润燥滑肠，为通调大便之佳品。宜食粗纤维食物，如芹菜、韭菜等。
检查肛瘘可以进行指诊，肛门指诊时可以在肛内齿线处触及到硬节或凹陷，或按压瘘管时有脓液流出。术前只有准确定位瘘管的位置，内口的位置，才能为手术的成功提供最有力的保障。内口的定位一般有两种方法，直接找和顺瘘管找。
检查肛瘘可以进行指诊，肛门指诊时可以在肛内齿线处触及到硬节或凹陷，或按压瘘管时有脓液流出。术前只有准确定位瘘管的位置，内口的位置，才能为手术的成功提供最有力的保障。内口的定位一般有两种方法，直接找和顺瘘管找。
有瘘道经常漏出来东西叫瘘，由于和肛门相通叫肛瘘，有的病比如髂关节结核，结核之后形成窦道，窦道也叫瘘道，窦道不叫肛瘘，肛瘘顾名思义，和肛门有关系的才能说是肛瘘。肛瘘的表现主要是有内口有外口还有窦道，它的表现反复感染，感染流出来之后就不疼，不流出来感染窦道就疼。
核磁共振检查肛瘘是了解报告单当中，对于病变大小，位置，病变内部以及病变周边的具体的描述情况，是否有异常的信用改变。以及对于病变四周的血管的描述，是否出现血管的丰富改变。