一旦确诊为肛瘘，唯一有效的方法就是手术的，除此之外没有任何保守疗法的，可以选择微创无痛手术的。建议多注意观察目前的情况，可以使用碘伏液进行擦拭消毒。疼痛感会随着时间慢慢减少减小。恢复需要一个多月的时间。
肛瘘是当周脓肿切开，所引起肛瘘。肛瘘的分型比较复杂，治疗方法有所不同。平时注意戒酒，戒辛辣等刺激性食物。注意多吃粗纤维食物，有利于大便的排出。平时要注意休息，多喝热水。
1.门直肠周围脓肿破溃或切开多在肛门外，脓液从外口流出，但原发感染多在肛窦。肛窦则是继发感染的门户，反复感染，形成瘘道。2.瘘道多在肛门括约肌之间通过，由于括约肌经常不断地收缩与舒张，压迫瘘道，影响脓液的排除，容易贮脓感染而难以愈合。3.直肠内有一定的压力，将直肠感染物质如粪便、气体，可经常不断地从内口进入瘘道，刺激腔壁，继发感染后由外口排出，也是造成瘘道的原因。
肛瘘可以选择手术进行治疗。有时可以暂时关闭瘘口而不排出脓肿，导致局部肿胀和疼痛，体温升高，随后封闭。闭合性瘘破裂，脓液排出。瘘管也可排出气体或粪便。同时要保持大便顺畅，不吃辛辣刺激性食物。
肛瘘是肛肠手术中常见的疾病。这种疾病的发生与人们的饮食习惯和饮食结构密切相关。去当地正规医院的肛门直肠外科进行外科治疗。手术后，应该多吃高纤维含量的新鲜蔬菜和水果，不要吃辛辣刺激的食物。