可以通过服用利水渗湿祛湿的药物来治疗，如果肾囊肿比较小是可以起到一定的效果的。中医认为本病多是由于肾精不足、痰瘀阻滞、脉络不畅所致。平时饮食宜清淡，注意防寒保暖，避免过度劳累。
中医可以治疗肾囊肿，对于肾囊肿的症状体积较小的表现可以选择不予处理，必要时可以选择进行手术治疗，平时注意饮食情况，加强营养，多吃一些新鲜的水果和蔬菜，不要过于劳累，按时休息。
看肾囊肿需要泌尿外科就诊，对小肾囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但应定期检查，观察囊肿是否继续增大。无症状者应经常进行尿液检查，包括尿常规、尿培养，每半年至一年进行一次肾功能检查，包括内生肌酐清除率。
如果是右侧肾脏囊肿，需要到医院的泌尿外科进行诊断和处理。
通常情况下，胚胎肾囊肿并不是必须要进行手术，而且目前还没有任何有效的治疗手段。大部分的肾结石，都是良性的，而且增长的很慢。所以，不会对孩子的身体造成太大的伤害。胎儿右侧肾脏囊肿需要经常到医院做检查，如果囊肿没有扩大，那么就不需要进行手术。囊肿有扩大需要手术。
肾囊肿是挂泌尿外科。肾囊肿可以分为单纯性肾囊肿和遗传性肾囊肿，大多数是单纯性肾囊肿。遗传性肾囊肿，比如多囊肾可能会影响肾功能。单纯性肾囊肿不影响肾功能，而且也没有什么特殊的症状，多半是在体检的时候发现。