治疗方法有以下两种，药物治疗：西医治疗扁平疣一般多会以药物为主，药物治疗扁平疣多从抗病毒、增强免疫功能方面下手。激光治疗：是目前治疗扁平疣比较常见的一种方法，激光治疗扁平疣在临床有较大优势，激光治疗的方法可以作用到疣体基底，被黑素颗粒吸收，使之凝固破裂和气化。
治疗办法有，药物治疗，物理治疗，包括冷冻及激光治疗。激光、冷冻等，治疗方针，根据病情的严重程度选择适宜的治疗措施，控制症状，提高患者生活质量。若不及时治疗会累及更多的皮肤，也可能传染给家人朋友。扁平疣患者要多吃蔬菜、水果，补充多种维生素，这样对于扁平疣患者的皮肤较好。
人体免疫力下降也容易导致疾病的发生，治疗期间可以加入薏米的，对于扁平疣的治疗我个人首选激光去除疣体，再结合药物治疗更佳。薏米有药食两用的功效，薏米有祛湿，提高免疫力的作用，对于用于扁平疣的治疗也是可以的，扁平疣属于病毒感染所引起的。
理论上有自限性可以自己消退，也有消退慢的，扁平疣的治疗根据皮疹发生的部位、大小、数目可以采用局部涂抹外用药物和配合口服调节免疫力的药物等。治疗期间注意卫生，保护皮肤，患处不要碰水。
如果患者出现了扁平疣的情况，可以使用激光治疗、手术治疗的方式进行缓解。
1、激光治疗：临床上常采取的激光是二氧化碳激光，可通过热效应破坏、汽化疣体，从而达到治疗效果。
2、手术治疗：二氧化碳激光治疗存在局限性，不适用于疣体面积较大的患者，如果扁平疣的体积比较大，可以采用手术治疗的方式进行改善。术后要注意局部的清洁卫生，也不要吃辣椒、生姜等辛辣刺激性食物，以免发生感染。
